Основные направления научных исследований:

Результаты научных разработок, выполненных при ее непосредственном участии в рамках Программ фундаментальных исследований РАН, отмечены в числе важнейших достижений РАН в области общественных наук в 2001–2014. По результатам исследования ею опубликовано свыше 100 научных работ.

Основные публикации:

• Климова Н.И., Кириллова С.А., Низамутдинов М.М. и др. Башкортостан – 2010. Программа социально-экономического развития Республики Башкортостан до 2010 года. М.: ЗАО «Издательство «Экономика», 2006. 604 с.;
• Климова Н.И., Кириллова С.А., Алтуфьева Т.Ю. и др. Качество экономического роста: теория и практика оценки и управления. М.: ЗАО «Издательство «Экономика», 2007. 218с.;
• Гайнанов Д.А., Низамутдинов М.М., Кириллова С.А. и др. Управление социально-экономическим развитием региона: проблемы, подходы, технологии. М.: ЗАО «Издательство «Экономика», 2007. 264 с.;
• Качество социальных услуг: оценка и управление / Под ред. С.А. Кирилловой. Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2009. 132 с.;
• Кириллова С.А., Кантор О.Г., Кузнецова Ю.А. О комплексной оценке уровня качества бюджетных услуг // Проблемы прогнозирования. 2009. №3. С.101-111;
• Кириллова С.А., Кантор О.Г. Региональное развитие и качество экономического пространства // Регион: экономика и социология. 2010. №3. С. 57-80;
• Кириллова С.А. Эволюция пространственного каркаса – от экономического к туристическому // Вестник УГАТУ: серия «Экономика». 2010. Т.14. №5 (40). С.225-232;
• Гайнанов Д.А., Кириллова С.А., Печаткин В.В. и др. Комплексная программа социально-экономического развития ГО город Уфа Республики Башкортостан на 2011-2015 годы. Уфа, Издательство «Слово». В 2-х ч. 2011. 220с.;
• Kirillova S. A., Kantor O. G. Regional Growth: the Quality of Economic Space // Regional Research of Russia, 2011. Vol. 1. No. 3 P. 199-209;
• Гайнанов Д.А., Тажитдинов И.А., Кириллова С.А. и др. Стратегическое планирование и аудит социально-экономического развития региона. Москва: Экономика, 2012. 310 с.;
• Гайнанов Д.А., Печаткин В.В., Кириллова С.А. и др. Инвестиционная стратегия городского округа город Уфа Республики Башкортостан на 2013–2018 годы. Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2013.  282 с.;
• Кириллова С.А., Кантор О.Г. Идентификация арктических регионов России с позиций пространственной неоднородности // Регион: экономика и социология. 2013. № 2. С. 48-65;
• Кириллова С.А., Кантор О.Г. Управление регионами с позиций устойчивого развития // Экономические и социальные перемены: факты, тенденции, прогноз. 2013. №5(29). С. 53-64;
• Гайнанов Д.А., Кириллова С.А., Гатауллин Р.Ф. и др. Развитие социального потенциала арктических регионов: оценка и управление // Российская Арктика: современная парадигма развития / под ред. акад. А.И. Татаркина. СПб.: Нестор-Истрия, 2014. 844 с.;
• Стратегический план экономического развития городского округа город Уфа Республики Башкортостан до 2030 года. Администрация г. Уфы, ИСЭИ УНЦ РАН: Коллективная монография // Под общ. ред. И.Ф. Хасанова, О.П. Красновой, Д.А. Гайнанова, В.В. Печаткина, С.А. Кирилловой. Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2015. 284 с.

Основные проекты, выполненные под руководством и с участием:  

• Программа развития основных отраслей ТЭК Республики Башкортостан на период до 2006г. (2001г.);
• Энергетическая стратегия Республики Башкортостан на период до 2020г. (2002г.);
• Программа «Энергосбережение в отраслях ТЭК Республики Башкортостан» в рамках Комплексной программы Республики Башкортостан «Энергосбережение на 2003-2005гг.» (2003г.);
• Оценка экономического, социально-экономического и эколого-экономического ущерба окружающей природной среде, наносимого строительством и эксплуатацией Юмагузинского водохранилища (2002г.);
• Экономическая энциклопедия регионов России. Республика Башкортостан (2003г.);
• Программа социально-экономического развития Республики Башкортостан до 2010 года (2005г.);
• Организационно-экономический механизм создания туристического кластера на территориях Абзелиловского и Белорецкого районов Республики Башкортостан (2008г.);
• Инвестиционный проект создания регионального туристско-рекреационного суперкластера федерального значения «Башкортостан» (2010г.);
• Комплексная программа социально-экономического развития городского округа город Уфа Республики Башкортостан на 2011 – 2015 годы (2010г.);
• Среднесрочные комплексные программы социально-экономического развития Зауралья и северо-восточных районов Республики Башкортостан на 2011-2015 годы (2011г.);
• Научно-методические рекомендации по формированию и сопровождению пилотных проектов по стратегическому планированию и аудиту социально-экономического развития Республики Башкортостан и Республики Татарстан (2011г.);
• Туристские паспорта 14 муниципальных образований Республики Башкортостан (2011г.). 
• Исследование методических и организационно-правовых вопросов обеспечения функционирования интегрированной контрактной системы Республики Башкортостан (2012 г.);
• Инвестиционный проект создания туристского центра с комплексным туристским маршрутом «По следам Салавата Юлаева»;
• Проект Концепции создания туристской зоны в муниципальном районе Салаватский район Республики Башкортостан с разработкой комплекса туристских маршрутов «По следам Салавата Юлаева» (2012 г.);
• Инвестиционная стратегия городского округа город Уфа Республики Башкортостан на 2013–2018 годы (2013 г.);
• Маркетинговый анализ рынка туристских услуг туристско-рекреационного кластера «Бурзянский» (2013 г.);
• Проект Стратегии развития научной и инновационной деятельности в Республике Башкортостан до 2020 года (2014 г.);
• Концепция Стратегического плана экономического развития городского округа города Уфа Республики Башкортостан до 2030 года (2015 г.).

Почетные звания и награды:

• Почетная грамота Правительства Республики Башкортостан (2010г.);
• Почетная грамота Министерства экономического развития Республики Башкортостан (2011 г.);
• Медаль Федеральной службы государственной статистики (2012 г.);
• Почетная грамота Республики Башкортостан (2015 г.).

Дополнительные сведения:

С.А. Кириллова является иностранным членом редакционной коллегии международного научного журнала VUSEM – Výskumný ústav ekonomiky a manažmentu (Research Institute of Economics and Management) (Slovakia).