За годы войны в Башкирскую АССР были эвакуированы около 200 предприятий, в т.ч. 6 авиационных. На Ишимбайском НПЗ на базе эвакуированного оборудования возникло газолиновое производство. Широко развернулось изыскание и использование местных топливно-энергетических ресурсов (природного газа, торфа, бурого угля). В конце 40-х годов прошлого века в РБ для утилизации попутных продуктов продуктов нефте- и газопереработки начали создаваться предприятия нефтехимии. В 1947 г. началось строительство Ново-Уфимского, в 1950 г. Ново-Ишимбайского, и в 1954 г. Черниковского (позже переименованного в Уфимский завод имени XXII съезда КПСС) нефтеперерабатывающих заводов.

За годы войны в Башкирской АССР было произведено сельскохозяйственной продукции почти на 1,5 млрд руб. или 2,2% всего ее производства в СССР. На фронт было отправлено 71 тысячу лошадей, 750 тракторов, продукты.

Бурное развитие нефтедобычи и нефтепереработки в республике в 50–60-х годах и необходимость снабжения населения продуктами питания обусловили потребность в научных исследованиях вопросов экономической эффективности развития нефтедобывающей, нефтеперерабатывающей и нефтехимической отраслей промышленности, а также связанных с ними смежных отраслей и аграрного сектора экономики.

В соответствии с запросом реального сектора экономики Башкирии в начале 60-х годах первая экономическая публикация Отдела экономических исследований Башкирского филиала АН СССР была посвящена исследованию путей снижения себестоимости и повышения рентабельности в нефтедобывающей промышленности (к.э.н. Г.Ф.-Р. Шафиков, к.э.н. Д.Ш. Давлетбаева). В это же время была опубликована работа о путях повышения производительности труда промышленного предприятия (на примере предприятий химической промышленности).

В 60-е годы приоритетное значение в тематике научных исследований приобрела разработка проблем эффективности воспроизводства и использования основных фондов и капитальных вложений. В эти годы Башкирия и прилегающие к ней нефтеносные провинции юга Урала являлись главными поставщиками сернистых и особенно высокосернистых нефтей в нашей стране. Сотрудники Отдела (к.э.н. В.Ф. Шматов, к.э.н. В.В. Шихов, к.э.н. Ю.М. Малышев и др.) впервые дали сравнительную оценку народнохозяйственной эффективности переработки сернистых и высокосернистых нефтей и потребления получаемых из них нефтепродуктов. Их выводы позволили по-новому ставить и решать вопросы технического совершенствования нефтеперерабатывающих заводов, развития добычи нефти в различных районах страны.

Учеными-экономистами Отдела экономических исследований (ОЭИ) были изучены важнейшие методические и практические вопросы определения эффективности капитальных вложений в нефтедобывающую промышленность на примере предприятий Башкирии и Татарии. В монографии, опубликованной по результатам этих исследований, дан анализ эффективности разработки важнейших месторождений нефти Башкирской и Татарской АССР. Исследования сроков службы бурового оборудования и особенностей его воспроизводства позволили внести ряд практических предложений, направленных на обоснование новых норм амортизационных отчислений, введенных в промышленности в 1963 г.

В 1962–1965 гг. в ОЭИ были выполнены работы по исследованию динамики основных показателей экономической эффективности использования производственных фондов в нефтяной, химической, нефтехимической, машиностроительной и других отраслях промышленности Башкирии. Выявлены особенности и предложены методы оценки эффективности производственных фондов отдельных предприятий и небольших их групп (кандидаты экономических наук В.В. Шихов, А.С. Самигуллин и А.Х. Хайруллин, Е.М. Бугера и др.).

Кандидаты экономических наук В.И. Лузин, А.Х. Хайруллин и А.С. Самигуллин, исследуя проблему учета затрат на геологоразведочные работы в издержках нефтедобывающей промышленности пришли, к выводу, что геологоразведочные работы являются частью затрат по созданию основных фондов нефтедобывающей промышленности в форме единой гидродинамической системы «скважина–залежь» с включением стоимости геологоразведочных работ и обустройства нефтепромыслов. К этому же периоду относится ряд работ в области проблем учета общественных издержек производства в нефтяной промышленности.

Во второй половине 60-х годов в ОЭИ была выполнена значимая работа по комплексному изучению эффективности капитальных вложений в добычу и переработку нефти (кандидаты экономических наук А.Х. Хайруллин, А.С. Самигуллин, М.М. Самихов и др.), в химическую и нефтехимическую промышленности (к.э.н. B.B. Шихов, к.э.н. Э.А. Прохорова, Н.С. Набиева, Е.М. Бугера), в энергетику (А.И. Макогонская). Исследования позволили решить ряд научно-методических вопросов по определению и оценке экономической эффективности капитальных вложений и основных фондов (сущность и методика определения временного лага, определение нормативов капитальных вложений и производственных фондов, подходы к оценке уровня сравнительной эффективности капвложений в нефтепереработке и нефтехимии и методы определения фактической эффективности использования фонда амортизации в промышленности и др.). В процессе исследований выявлена наметившаяся тенденция снижения эффективности капитальных вложений и производственных фондов в ведущих отраслях промышленности республики, предложены меры по нивелированию сложившегося положения.

Предложения Отдела по результатам исследований были представлены в ЦК КПСС, Госплан СССР (межведомственную комиссию), ОК КПСС, Совет Министров и Госплан БАССР и реализованы рядом постановлений руководящих и партийных органов союзного и республиканского уровней.

Вопросам подъема экономики, повышения товарности и доходности колхозов горных и предгорных районов Башкирии были посвящены исследования, выполненные в ОЭИ под руководством профессора Г.З. Хамидуллина. Были предложены методика и принципы естественно-исторического районирования горной Башкирии, выделены природно-хозяйственные районы и микрорайоны как основа рациональной специализации и интенсификации производства. Разработанная методика для районирования горной Башкирии использовалась при комплексном районировании других горных территорий СССР. Всего в республике были выделены 7 районов, 16 микрорайонов и 8 производственных типов хозяйств.

Освоение целинных земель Башкирского Зауралья (в регионе с площадью около 3,2 млн га было вспахано дополнительно около 0,5 млн га сельхозугодий, что в 10 раз больше площади пашни в 1913 г.) явилось важным этапом развития исследований ОЭИ в сфере аграрной экономики. В развитие научных основ экономики аграрно-промышленного комплекса и в связи с необходимостью использования экономических рычагов в управлении аграрной экономикой исследования экономистов-аграрников в этот период сосредоточились на изучении таких категорий, как себестоимость, цена, рентабельность, хозрасчет в сельском хозяйстве, особенно в колхозах. Первые работы по данной тематике были посвящены изучению себестоимости продукции на примере типичных колхозов в различных зонах республики.

Задачей тематической группы в ОЭИ, возглавляемой к.э.н. М.И. Такумбетовым, явилось изучение вопросов внедрения и укрепления хозяйственного расчета в колхозах. В результате – предложена система внутрихозяйственного расчета в колхозах, обеспечивающая учет результатов деятельности каждого подразделения и включающая методику составления хозрасчетных заданий, текущего контроля и подведения годовых итогов его выполнения, а также организацию учета и отчетности в подразделениях.

В тесном сотрудничестве ученых ОЭИ с экономистами-практиками была проведена апробация результатов исследования по внедрению гарантированной оплаты труда, по внутрихозяйственному расчету в пяти хозяйствах республики. По результатам изысканий, выполненных непосредственно в хозяйствах, была опубликована книга «Хозрасчет и денежная оплата труда в колхозах».

По поручению органов государственного управления Башкирской АССР научными сотрудниками Отдела М.И. Такумбетовым, К.Ш. Багамановым и М.С. Губайдуллиным была разработана методика размещения плана государственных заготовок сельскохозяйственных продуктов по районам и хозяйствам республики.

В 1962–1965 гг. под руководством М.И. Такумбетова была осуществлена разработка теоретических и практических вопросов экономического обоснования оптимального сочетания фондов накопления и потребления. Результаты исследований по этой теме обобщены и опубликованы в коллективной монографии «Накопление и потребление» (М., 1967) и в монографии А.И. Грековой «Экономические стимулы повышения доходов в колхозах» (Уфа, 1967). В изданных работах освещается состав общественного продукта колхозов, особенности образования и распределения в них валового и чистого доходов, воспроизводства и использования производственных фондов. На материалах многолетних данных раскрываются пути увеличения валового дохода колхозов и рационального сочетания накопления и потребления. Это позволило разработать предложения по основной и дополнительной оплате труда в колхозах.

В секторе хозрасчета и материального стимулирования ОЭИ были проведены исследования по теме «Внутризональная дифференциация доходов колхозов и роль материального стимулирования в выравнивании экономических условий их повышения» (д.э.н. М.И. Такумбетов, д.э.н. У.Г. Гусманов). Составной частью работ по этой теме является качественная оценка земель республики. Под научным руководством д.э.н. У.Г. Гусманова разработаны вопросы методологии исследования и оценки конечного продукта АПК, обоснованы система стимулирования труда в аграрной сфере и направления совершенствования форм организации производства.

В этот период ученые ОЭИ в своих исследованиях начинают широко использовать экономико-математические методы и электронно-вычислительную технику. Под руководством к.э.н. Р.М. Зуфарова в 1966 г. был подготовлен, обсужден и одобрен на научно-техническом совете Министерства сельского хозяйства РСФСР проект методики оптимального планирования производства.

В ОЭИ было начато изучение вопросов, связанных с проблемой рационализации межрайонных транспортных связей. В публикациях по этой тематике рассматриваются особенности формирования транспортных связей республики, указываются недостатки, вскрываются их причины, намечаются пути устранения последних.

В 60-е годы под руководством к.г.н. В.Н. Кузнецова, при активном участии работников Госплана БАССР в ОЭИ было проведено исследование по экономическому обоснованию развития генеральной сети автомобильных дорог Башкирии. Результаты этой большой работы легли в основу перспективного плана строительства автомобильных дорог республики. В ней дана оценка природных и экономических условий Башкирии с позиций их влияния на работу транспорта, анализ показателей работы отдельных видов транспорта, намечены пути их дальнейшего развития, проведено транспортно-экономическое районирование и дана характеристика выделенных районов.

Сотрудниками сектора эффективности производственно-экономических связей ОЭИ был разработан ряд тем, актуальных для народного хозяйства не только Башкирии, но и юга Урала и Поволжья. В их числе оценка экономической эффективности существующих и перспективных транспортных связей отдельных отраслей народного хозяйства Поволжья, в том числе и Башкирии, полученная также с применением экономико-математических методов и ЭВМ. Результаты исследований этого сектора были внедрены со значительным экономическим эффектом.

На основе применения экономико-математических методов была разработана первая в БФАН СССР программа решения транспортной задачи линейного программирования методом дифференциальных рент. В 1966 г. основные результаты этих исследований обсуждены и одобрены на научно-техническом совете Министерства сельского хозяйства РСФСР, а затем опубликованы. Решены экономико-математические задачи по оптимизации перевозок продуктов и оптимизации продуктовой структуры сельскохозяйственного производства.

Предложен порайонный метод координации работы различных видов транспорта при вывозе светлых нефтепродуктов, основанный на использовании многоэтапной двухпродуктовой транспортной задачи линейного программирования. Для реализации разработанного в Отделе экономических исследований метода текущего и оперативного планирования перевозки нефтепродуктов из районов Поволжья железнодорожным, речным и трубопроводным транспортом была создана специальная группа при Поволжском отделении Главнефтеснаба РСФСР.

В целях расширения исследований с использованием экономико-математических методов в составе Уфимского отдела экономических исследований АН СССР в 1967 г. организован Сектор оптимизации планов сельскохозяйственного производства (зав. сектором к.э.н. Р.М. Зуфаров).

            Таким образом, ученые-исследователи Отдела экономических исследований БФАН СССР своими глубокими и продуманными исследованиями, отвечающими потребностям реальной практики, внесли значительный вклад в восстановление экономической науки и экономики Башкирии.