1. Печаткин, В.В. Современные проблемы эколого-экономической оценки лесов Республики Башкортостан / В.В. Печаткин, Ф.Н. Гарипов, А.Ю. Кулагин. – Уфа: Гилем, 2005. – 130 с.
2. Ахметов, Т.Р. Глобальная интеграция и ВТ / Т.Р. Ахметов. –Уфа: Издательство Диалог, 2006. – 148 с.
3. Методология и инструментарий оценки потенциала саморазвития территорий. Управление социально-экономическим развитием региона: проблемы, подходы, технологии // Под ред. Д.А. Гайнанова. – М.: ЗАО «Издательство «Экономика», 2007. – С. 61-112, 142-154.
4. Новоселова, О.В. Оценка структурных сдвигов в промышленности Республики Башкортостан/О.В. Новоселова. – Уфа, 2008. –31 с.
5. Формирование и развитие региональных кластеров: теоретико-методические и прикладные аспекты (на примере Республики Башкортостан): Монография//Под ред. Д.А. Гайнанова. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2009. – 164 с.
6. Качество социальных услуг: оценка и управление // Под ред. С.А. Кирилловой. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2009. – 132 с.
7. Инвестопроводящая система инновационной экономики региона: Монография / Под ред. Д.А. Гайнанова. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2009. – 190 с.
8. Комплексная программа социально-экономического развития городского округа город Уфа Республики Башкортостан на 2011–2015 годы (в 2-х частях). – Уфа: Издательство «Слово»,2011. – 220 с.
9. Среднесрочная комплексная программа экономического развития Зауралья на 2011-2015 гг. Правительство Республики Башкортостан, ИСЭИ УНЦ РАН. –М.: ЗАО «Издательство «Экономика», 2011. – 384 с.
10. Стратегическое планирование и аудит социально-экономического развития региона // Под ред. И.А. Тажитдинова, Д.А. Гайнанова, С.В. Новикова, С.А. Кирилловой. – Москва: Экономика, 2012. – 310 с.
11. Среднесрочная комплексная программа социально-экономического развития северо-восточных районов Республики Башкортостан на 2011–2015 годы. Правительство Республики Башкортостан, РАН, Институт социально-экономических исследований. – Москва: Экономика, 2012. – 392 с.
12. Инвестиционная стратегия городского округа город Уфа Республики Башкортостан на 2013 – 2018гг.: Коллективная монография // Под ред. И.Ф. Хасанова, Д.А. Гайнанова, В.В. Печаткина, С.А. Кирилловой. – Уфа: Администрация г. Уфы, ИСЭИ УНЦ РАН, 2013. – 335 с.
13. Печаткин В.В. Кластерный опорный каркас регионов России. Теория и практика проектирования и развития. – Saarbrucken: LAPLAMBERT, 2013. – 140 с.
14. Российская Арктика: современная парадигма развития: Коллективная монография // Под ред. А.И. Татаркина. –СПб.: Нестор-История, 2014. – 808 с.
15. Стратегический план экономического развития городского округа город Уфа Республики Башкортостан до 2030 года. Администрация г. Уфы, ИСЭИ УНЦ РАН: Коллективная монография // Под общ. ред. И.Ф. Хасанова, О.П. Красновой, Д.А. Гайнанова, В.В. Печаткина, С.А. Кирилловой. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2015. – 284 с.
16. Печаткин В.В., Перфилов В.А. Импортозамещающая кластерная политика региона: теория и практика. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2016. – 196 с.
17. Основы управления инновационным потенциалом разноуровневых социально-экономических систем: монография // Под общ. ред. А.М. Мухамедьярова. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2016. – 242 с.
18. Кириллова, С.А. Туристско-рекреационный кластер на Павловском водохранилище: создание и развитие / С.А. Кириллова, Д.С. Орлова, Е.С. Каширина, Ю.А. Кузнецова / под ред. С.А. Кирилловой. – Уфа: ИСЭИ УНЦ РАН, 2017. – 220 с.
19. Гарипова З.Ф., Гарипов Ф.Н. Ресурсные проблемы экономического развития на современном этапе – Уфа: ИСЭИ УФИЦ РАН, 2017. – 111 с.